In Jena finden sich zahlreiche Ferienwohnungen, die eine flexible und oft günstigere Alternative zu Hotels bieten. Die Apartments liegen häufig zentral, etwa in der Altstadt oder in Stadtteilen wie Ziegenhain, und sind ideal für Familien oder Geschäftsreisende. Zur Ausstattung gehören meist eine voll ausgestattete Küche, kostenloses WLAN sowie kostenfreie Parkplätze. Die Preise variieren je nach Lage und Größe, beginnen aber oft bei moderaten Raten.
Besonders hervorzuheben sind die Jena The Grand Piano Suite (97 Punkte) in einem historischen Gebäude mit Kamin und Stadtblick, sowie die Ferienwohnung im idyllischen Jena Ziegenhain (95 Punkte) mit Bergblick und Garten. Familien schätzen die großzügigen Apartments wie Ferienwohnung Jenzigblick (93 Punkte) mit Balkon und Waschmaschine. Anders Apartments (93 Punkte) überzeugt durch zentrale Lage nahe JenTower und eigenem Restaurant.